高通量测序中，BWA比对软件如何使用？ - 知乎
BWA-SW： 用于较长序列，支持长度为70bp-1M，同时支持剪切性比对（split alignments）； BWA-MEM （首推）：最新的算法，同样支持较长序列和剪切性比对（split alignments）， …
博格华纳是一家什么样的公司？ - 知乎
博格华纳 博格华纳公司（纽交所：BWA）是美国汽车零部件供应商，总部位于密歇根州的奥本山。公司在全球24个国家的96个地区拥有制造和技术中心，在全球拥有约50,000名员工（截 …
用bowtie2软件建立基因组的索引，这个结果怎么看？是否成功 …
Mar 21, 2020 · 比 BWA 等最先进的工具快 10-100 倍。 SNAP 大大减少了本地对齐检查的数量和成本 （使用更长的种子来减少错误 考虑正位置，利用更大的内存容量来加速索引查找，并在 …
踏踏实实做技术：BWA，Bowtie，Bowtie2的比对算法推导 - 知乎
Jun 3, 2024 · 今天给大家介绍一下BWA，Bowtie，Bowtie2比对算法的原理。 二代测序技术或者说是高通量测序技术产生的数据有几个明显的特征：1是测序数据量大，2是序列比较短，3是测 …
全基因组构建进化树? - 知乎
构建全基因组进化树是系统生物学和比较基因组学中的重要任务，用于揭示物种间的进化关系和遗传差异。以下是详细的步骤和方法指南： 一、核心步骤 1. 数据获取与预处理 - 基因组数据下 …
北京基因组研究所的李恒博士有多牛？ - 知乎
是一个凭一己之力写出 BWA软件 的人。 我听过的故事是，李恒教授想了很久的一个程序，然后有一天开始自己动手写，没有找任何人，然后写出了bwa。
用BWA做SNP时候，出现fail to locate the index，怎么解决？
使用bwa aln或bwa mem 命令进行比对前，用 bwa index reference.fasta 命令将参考序列建立索引，并将产生的5个索引文件放在同一个目录中。
重测序结构变异 (SV)? - 知乎
全基因组重测序 检测（SNV, InDel,SV,CNV）存在不同验证手段： 1)SNPs及InDel可对含有此位点的片段进行PCR扩增及一代测序（sanger）；也可使用SNP分型检测 (如KASP)检定。
生信小白 安装miniconda软件一直显示Solving environment: failed?
Dec 31, 2023 · 网上找的教程在服务器上安装了miniconda，想用conda命令安装一些基本的分析软件，但一直显示Solving envi…
请问现在三代测序的reads用什么比对？ - 知乎
而且在长序列比对方面，bwa-mem无法对目前的三代测序数据（PacBio和Nanopore）做比较好的比对，按照lh3文章中的说法minimap2不但能够解决长序列比对，而且速度相比于bwa-mem还 …